1998年6月24日～1998年7月31日，为配合京珠高速公路工程施工，湖北省文物考古研究对孝昌古坟岗墓地进行了发掘。共发掘古墓8座。项目负责人杨权喜。
1998年夏，为配合京珠国道工程，湖北省文物考古研究所同孝感市博物馆、大悟县博物馆对大悟张家湾遗址、墓地进行了抢救性发掘。
1998年夏，为配合京珠国道工程，湖北省文物考古研究所、孝感市博物馆和大悟县博物馆于对大悟李家湾遗址进行发掘。
1998年9月下旬，为配合长荆铁路（应城长江埠至荆门）建设，湖北省文物考古研究所会同铁路沿线有关市县博物馆专业人员对将要先期动土施工的钟祥、应城两市境内铁路沿线进行了文物普查，共发现地下文物点十四处，其中古文化遗址三处，古墓地九处，既有早期古文化遗存，又有晚期古慕葬的文物点两处。在上述文物点中，狮子山遗址、门板湾遗址两处遗址的古代文化遗存较为丰富，采集到了不少标本。
1998年10月，湖北省文物考古研究所在秭归县柳林溪发现新石器时代至六朝遗址，完成发掘面积1325平方米。在遗址的东部首次发现并清理出东周时期的方形房基1座，该遗址提示出的相当于白庙时期的文化层，对进一步研究三峡地区特别是西陵峡段夏商时期的考古学文化分布区域和文化面貌具重要意义。在三峡地区首次发现和确认的大溪早期文化与城背溪文化直接叠压的地层关系，这是继在三峡工程坝区杨家湾遗址发现大溪文化刻划符号后的又一次的集中发现。
1998年10～11月，为配合三峡大坝工程建设，湖北省文物考古研究所于对秭归王家湾遗址残存部分进行了全面发掘。发掘面积550平方米。项目负责人杨权喜。
1998年10～12月，为配合三峡大坝二期工程建设，湖北省文物考古研究所对秭归文堰湾与谭家河遗址进行了抢救性发掘。发掘面积825平方米。出土遗物以板瓦、筒瓦为大宗。
1998年10月～1999年1月，湖北省文物考古研究所在秭归东门头古城发掘及新石器时代至明代遗址。完成发掘面积约1000平方米，出土各类珍贵文物约600件，对深入理解三峡地区聚落的形成发展与特点、研究其历史文化具有重要学术价值。
1998年10月23日～11月16日，为配合三峡大坝工程建设，湖北省文物考古研究所对秭归埂子上遗址进行了第一次抢救性发掘。项目负责人黄凤春。
1998年11月2日～12月5日，湖北省文物考古研究所对巴东店子头遗址进行了发掘工作。发掘面积136平方米。
1998年11月17日～12月15日，为配合三峡工程建设，湖北省文物考古研究所对秭归黄土嘴遗址进行了抢救性发掘。发掘面积500平方米。项目负责人梁柱。
1998年11月7日～1999年1月19日，为配合三峡大坝工程建设，为抢救三峡大坝蓄水后将被淹没的地下文物，湖北省文物考古研究所对巴东红庙岭遗址进行了第一次大规模考古发掘。
1998年12月4～25日，湖北省文物考古研究所在巴东土寨子遗址进行了考古发掘。
1998年底～1999年，湖北省文物考古研究所对长荆铁路门板湾遗址进行第一次发掘，2000年初进行第二次发掘。门板湾遗址是一处以城址为中心聚落，城外分布有数个半从属聚落的新石器时代大型聚落遗址。门板湾遗址总面积约110万平方米，属屈家岭文化和石家河文化时期。
